新疆轻工学院的挑战杯起源于2010年，当时学校在科技方面发展刚刚起步，在该年10月由一名食品与生物学院的新入职教师徐效圣老师亲自组建与成立了“校科技创新协会”，徐效圣老师本身专业素质比较强，硕士研究生学历，并且多次参加挑战杯大赛获奖，其中于2009年参加“全国第十一届大学生挑战杯（北京航空航天大学）”获全国三等奖，其理念是为我校科技创新爱好者及有创新意向的同学提供专业培训和指导，为有创新经验的同学提供用武之地，为老师和同学、同学和同学构建一座沟通的桥梁，直击全国大学生创新设计大赛、全国大学生挑战杯、全国大学生创新性实验计划，科技论文报告会等各大赛事，为各大赛事提供我校的更有创新性、更有技术含量，更有专业标准的创新项目，让我校学生在科学研究方面再上新台阶。

     新疆轻工学院的挑战杯之后的各项赛事，均开始由校科技创新协会承办，并且多次参加了新疆赛区的各项比赛，并获得了很多成绩，也培养了相关创新技能人才。

     2011年5月参加了“第十二届全国大学生挑战杯校外科技作品大赛新疆赛区终审决赛”（新疆师范大学举办），申报两项作品，均获新疆区三等奖。

     2013年，由于当年信息获得较晚，没有参加上比赛，很是伤心，大挑是两年一届。

     2014年5月参加了“首届“挑战杯——彩虹人生”全国职业学校创新创效创业大赛”，学生作品获全国赛区终审决赛三等奖。

    2015年5月参加了“第十四届全国大学生挑战杯校外科技作品大赛新疆赛区终审决比赛”（新疆医科大学），申报一项作品，获新疆区三等奖。