2007年，我校被批准为首批大学生创新性实验计划项目实施单位，是入选的全国60所高校中唯一的一所独立设置医学类院校。该项目实施以来，我校共立项国家级大学生研究性学习和创新性实验计划项目110项，国家级大学生创新创业训练计划项目212项，北京市的市级大学生科学研究与创业行动计划项目128项，项目总数达到450项，直接参与项目的大学生超过2250人次。在项目推动下，全校大学生自主学习、自主研究和自主创新和自主创业蔚然成风。近六年来，在前六届全国大学生创新论坛上，我校有多名参与项目的本科生论文入选并在大会交流；在北京市“挑战杯”首都大学生课外学术科技作品竞赛中，共22支团队获得奖项。同时，我校搭建了全国高等中医药院校大学生课外学术科技作品比赛的交流平台，并在首届比赛中荣获一等奖1项、三等奖2项；在首届“天堰挑战杯”全国高等医学院校大学生中医药创意设计竞赛中，获得二等奖1项。在第二届首都大学生科技创新作品与专利成果博览会中，有2项创意成果参加博览会展示，同时涌现出一批大学生科技创新作品。