基本信息
- 项目名称：
- 提取基因组DNA的优化方法
- 来源：
- 第十二届“挑战杯”省赛作品
- 小类：
- 生命科学
- 大类：
- 自然科学类学术论文
- 简介：
- 针对传统基因组DNA提取方法存在的问题，本组成员提出该优化方法，此方法操作简单、节省时间、无毒安全且纯度较高，值得在今后的分子生物学领域广泛推广、运用。
- 详细介绍：
- 以大泷六线鱼（Hexagrammos otakii Jordan et Starks）的大侧肌肌肉为材料，分别采用传统的苯酚-氯仿法和优化的基因组DNA提取方法提取大泷六线鱼基因组DNA。对两种方法提取的结果进行了紫外分光光度和琼脂糖凝胶电泳检测。结果显示，本优化方法提取的鱼类基因组DNA的D260nm/D280nm比值为1.66～1.68，传统方法提取的DNA的D260nm/D280nm比值为1.71～1.90，均在正常范围之内。琼脂糖凝胶电泳检测结果显示两种方法所提取的DNA的浓度没有显著差异。所提取的DNA可以满足相关分子生物学研究的需要。而且优化后的方法操作更为简洁，操作过程中避免了实验人员与毒性较大的苯酚、氯仿的接触。因此，该基因组DNA提取方法效果较好，具有一定的应用价值。
作品专业信息
撰写目的和基本思路
- 研究鱼类基因组DNA提取的优化方法在分子生物学基础上对传统基因组DNA提取方法的优化
科学性、先进性及独特之处
- 实验在专业实验室中进行，采取对比的科学实验方法，确保了实验的规范性和数据的准确性；本实验避免了与毒性较大的苯酚、氯仿的接触，实验时间较短，操作简便；值得在分子生物学领域广泛推广。
应用价值和现实意义
- 本优化方法更有利于基因组DNA的提取，实验过程简便、安全，更有利于实验员实际操作，为分子生物学的发展奠定基础。
学术论文摘要
- 以大泷六线鱼（Hexagrammos otakii Jordan et Starks）的大侧肌肌肉为材料，分别采用传统的苯酚-氯仿法和优化基因组DNA提取方法提取大泷六线鱼基因组DNA。对两种方法提取的结果进行了紫外分光光度和琼脂糖凝胶电泳检测。结果显示，本优化方法提取的鱼类基因组DNA的D260nm/D280nm比值为1.66～1.68，传统方法提取的DNA的D260nm/D280nm比值为1.71～1.90，均在正常范围之内。琼脂糖凝胶电泳检测结果显示两种方法所提取的DNA的浓度没有显著差异。所提取的DNA可以满足相关分子生物学研究的需要。而且优化后的方法操作更为简洁，操作过程中避免了实验人员与毒性较大的苯酚、氯仿的接触。因此，该基因组DNA提取方法效果较好，具有一定的应用价值。
获奖情况
- 大连海洋大学初评二等奖
鉴定结果
- 实验结果达到了预期效果
参考文献
- [1]刘 臻、鲁双庆、肖调义、陈开键。鲫鱼基因组DNA 提取方法的探讨，水利渔业，2004，24（6）：20～22 [2]张德华、周开亚 、孙红英。乙醇保存的动物标本基因组DNA 提取方法的比较，生物学杂志，2004，21（6）:46～48 [3] 马洪雨、姜运良、岳永生。一种从鱼类肌肉组织中提取基因组,的简易方法，生物技术通讯，2005,16（5）：531～532 [4]张锐 、孙美榕 、林洽辉、杨燕贞、曾苑玲。鱼类基因组DNA提取方法的优化及PCR扩增，水利渔业，2006,26（4）：7～9 [5]乐小亮、章群赵爽、范凤娟 。一种高效快速的鱼类标本基因组DNA提取方法,生物技术通报，2010，（2）：202～204 [6]张继民、刘霜 一、赵建民 、马兆党、张洪亮 。带鱼(Trichiurus haumela)鱼卵DNA的提取及其18SrDNA初步分析，海洋通，2009,28（6）：62～65 [7]李明云、张海琪。大黄鱼高质量基因组DNA的简便提取方法，实验与技术，2002,26(10）：15～17 [8]张祖兴、李明云、张春丹、刘伟成、管丹冬 。大黄鱼血液基因组DNA的提取及其效果，水利渔业，2006,26(3）：24～25 [9]汪立平、马相杰、赵勇。罗非鱼幼鱼肠道微生物基因组DNA的提取；湖南农业科学；2009，(10)：147～15 [10] 汪永庆、王新国、徐来祥等。一种动物基因组DNA提取方法的改进，动物学杂志，2001，36(1)：27～29
同类课题研究水平概述
- 近年来我国水产行业发展迅速，市场对水产品的需求量越来越大，导致野生水生资源的匮乏；同时，对养殖品种的质量要求也在不断提高，故为了保护和开发我国水产生物资源 ,了解和研究其遗传特性, 分子生物学技术必将成为其遗传分析和品种改良的有力工具之一, 而提取高质量的鱼基因组DNA是进行各种分子生物学研究的基础和前提。尽管当前国内外对基因组DNA的提取方法在不断改进、优化，从试剂盒法到苯酚－氯仿提取法，所用技术不断更新，操作也逐渐简化，提取的基因组DNA的纯度也在不断提高，而我们的优化方法在过去传统方法的基础上进行改进，提取的基因组DNA清晰度、完整度、纯度与以往方法均无明显差异，但我们的方法实验时间较短，操作简便，避免了与毒性较大的苯酚、氯仿的接触，对于提取基因组DNA不失为一种更好的方法，但整个实验操作过程仍有些许值得改进的地方，愿后来者继续改进，为分子生物学的科技进步贡献力量！
