以《金匮要略》中记载的复方中药“泻心汤”为研究对象，通过文献检索共获得复方中药泻心汤中的大黄、黄芩、黄连三个药用植物中1288个天然化合物，以这些化合物为模板，采用分子拆分、重组、和分子量匹配的方法，即可快速获得中药复方泻心汤中的实际化学成分。这种以药用植物中的天然产物为模板，采用分子拆分、重组和分子量匹配的方法来确定复方中药里的化学成分的新方法，称之为“分子重组匹配法”。

“分子重组匹配法”是以药用植物中的天然化合物为模板，首先采用遗传算法和逆合成分析法，把药用植物中的全部天然化合物拆分成分子碎片（合成子），然后对所有合成子重新进行相互交叉组装，获得海量的虚拟化合物库（二维结构），虚拟化合物库中的分子包含了原来药用植物中的天然化合物以及药物炮制过程中可能产生的化合物（逆合成分析法把每一个分子拆分成最小化合成子，然后组装。理论上充分考虑到化合物分子之间所有可能发生的反应。因此，产生的虚拟化合物数量庞大，理论上应该包含了炮制过程中产生的化合物），最后借助ESI HR MS技术测定中药方剂中化合物的分子量，通过分子量的匹配，从海量的虚拟化合物库中进行分子量匹配，来确定复方中药里的实际化合物结构。
分子重组匹配法能够快速有效地揭示单方和复方中药药效的物质基础，为中药现代化提供了一种有效的解决思路，解决了中药现代化中的一个关键技术问题。

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