主办单位: 共青团中央   中国科协   教育部   中国社会科学院   全国学联  

承办单位: 四川大学     

基本信息

项目名称:
水产品中诺如病毒的检测及其系统发育分析
小类:
生命科学
简介:
本论文研究水产品中诺如病毒的高效病毒浓缩、提取方法,建立诺如病毒RT-PCR检测方法,对水产品样品和腹泻病人粪便样品进行检测,对阳性病毒蛋白进行三级结构预测并建立同源模型。通过借助BLASTX比对、进化树构建等生物信息学方法,对检出的阳性病毒进行型别鉴定与系统发育分析,蛋白质三级结构预测,3D同源建模为进一步探索水产品中诺如病毒流行规律和流行因素,制订诺如病毒引起的食源性疾病防控对策提供技术依据。
详细介绍:
本论文研究水产品中诺如病毒的高效病毒浓缩、提取方法,建立诺如病毒RT-PCR检测方法,对水产品样品和腹泻病人粪便样品进行检测,对阳性病毒蛋白进行三级结构预测并建立同源模型。通过借助BLASTX比对、进化树构建等生物信息学方法,对检出的阳性病毒进行型别鉴定与系统发育分析,蛋白质三级结构预测,3D同源建模为进一步探索水产品中诺如病毒流行规律和流行因素,制订诺如病毒引起的食源性疾病防控对策提供技术依据。

作品专业信息

撰写目的和基本思路

本研究以水产品中污染的诺如病毒为研究对象,研究诺如病毒灵敏、快速的分子检测和高效的病毒浓缩方法,并对实际样本中诺如病毒的污染状况进行调查,为进行流行病学调查研究和大规模突发性疾病暴发时病因的溯源打下基础。

科学性、先进性及独特之处

国内外针对腹泻性病人粪便样品诺如病毒的检测已有较深入的研究报道,但以水产品等传播载体进行探究的相关文献报道相对较少。本研究主要针对水产品预处理(病毒浓缩)、诺如病毒快速检测方法建立及其分子流行病学等开展研究与探索,首次对厦门及周边地区的水产品中诺如病毒污染情况进行了调查,并对检测出阳性病毒菌株核酸进行蛋白质三级结构预测及3D同源建模。

应用价值和现实意义

诺如病毒是引起食源性病毒性腹泻性疾病的重要病因之一。贝类等水生生物由于其滤过性摄食的特性,被认为是诺如等食源性病毒传播的高危载体。目前,尚无详尽的相关病毒学标准用于诺如病毒的检测。因此,建立便捷、可靠的诺如病毒检测方法,就厦门及周边地区的水产品进行病毒污染情况调查,具有较好实际应用价值和现实意义。

学术论文摘要

本论文研究水产品中诺如病毒的高效病毒浓缩、提取方法,建立诺如病毒RT-PCR检测方法,对水产品样品和腹泻病人粪便样品进行检测,对阳性病毒蛋白进行三级结构预测并建立同源模型。通过借助BLASTX比对、进化树构建等生物信息学方法,对检出的阳性病毒进行型别鉴定与系统发育分析,蛋白质三级结构预测,3D同源建模为进一步探索水产品中诺如病毒流行规律和流行因素,制订诺如病毒引起的食源性疾病防控对策提供技术依据。

获奖情况

获第五届“挑战杯”集美大学学生课外学术科技作品竞赛自然科学类三等奖

鉴定结果

参考文献

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同类课题研究水平概述

近年来世界范围内相继报道多起食物因污染Nov病毒导致急性胃肠炎的暴发和散发,引起了各国政府和科学工作者的重视。目前,诺如病毒的诊断方法主要有直接电镜法、免疫电镜法(IEM)、放射免疫法(RIA)、酶免疫分析法(EIA)、RT-PCR等。由于诺如病毒目前无法进行细胞培养,而且在水产品中诺如病毒含量一般较低,检测有一定难度。近30年来随着检测手段的发展和调查研究的深入,检测技术有较大的突破,例如,Herrmann等建立了用甘氨酸缓冲液从海产品组织中直接洗提病毒的方法;张颖等人应用RT-PCR方法检测贝类中诺如样病毒的研究;Green李晖等将巢式RT-PCR方法应用到贝类样品诺如病毒检测中, 其灵敏度比单轮RT-PCR方法提高了10-1000倍;Myrmel等利用荧光定量RT-PCR和荧光定量nested RT-PCR对挪威海岸水产品中肠道病毒进行了检测分析,贝类样品诺如病毒检出率为6. 8%, 冬季更高;潘良文等建立了从贝类中提取诺如病毒的RNA并进行实时荧光RT-PCR检测方法;苏来金等初步建立了贝类中诺如病毒SYBR Green I实时定量RT-PCR检测方法,比常规RT-PCR方法敏感100倍,并对所检测到的贝类中阳性株核酸片段进行克隆、转化、序列分析和同源比对,显示5份诺如病毒阳性株均为GGII型,与国内报道的GII型毒株同源性达到98%以上;汪俊等对太平洋牡蛎中诺如病毒检出的2株阳性样品进行了序列分析,表明贝类中诺如病毒与肠胃炎病人粪便中诺如病毒的高同源性。诺如病毒在自然界中的宿主、
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